Der Nachfolger von Puyo Puyo ist wie sein Vorgänger ein Fallblockspiel, bei dem das Ziel darin besteht, vier oder mehr Blöcke (Puyos) derselben Farbe zu kombinieren, die dann verschwinden. Die verbleibenden Puyos fallen dann herunter und können Kombos erzeugen, die dazu führen können, dass spezielle Blöcke (Störende Puyos, die nur durch die Beseitigung benachbarter Puyos zerstört werden können) auf dem Feld des Gegners erscheinen.