In den meisten Gebieten muss Pachio-kun ein oder mehrere Pachinko-Spiele absolvieren, um den Ort verlassen und die Handlung vorantreiben zu können. Pachinko-Maschinen gibt es in verschiedenen Geschmacksrichtungen und Schwierigkeitsgraden. Die Steuerung ist ziemlich einfach und erfordert, dass der Spieler die Stärke des Schusses anpasst; die Schüsse selbst können automatisch abgefeuert werden. Das Spiel wurde mit einem speziellen Controller ausgeliefert, der einem echten Pachinko-Gerät ähnelt.